仁济医院感染科成立于2004年11月，病房大楼于2022年1月5日竣工，独立建筑，地上5层地下1层，总建筑面积5000平方米。经过新冠疫情的洗礼，仁济医院感染科逐渐成长为感染防控的中坚力量，建立了医疗团队以及人才梯队，有主任医师1名、副主任医师2名、副研究员1名，其中硕士生导师2名，主治医师4名以及住院医师5名。秉承“厚植仁济情怀，求实创新进取”的发展理念，科室逐渐形成了免疫低下感染的临床特色，在多重耐药菌感染、肠道来源感染以及肺部复杂感染等危重症感染经验丰富。作为浦东新区的示范性感染病治疗中心，有负压隔离病房10间，配备有呼吸机、高流量吸氧装置、纤维支气管镜、血液净化设备、ECMO和主动脉球囊反搏仪等医疗设备，满足危重患者救治。发热门诊位于感染楼1层，有独立诊室3间，有单独的挂号、检验、CT检查以及药房配置，为发热病人提供一站式服务。感染科成立微生态诊疗中心，以肠菌移植为抓手，规范难治性艰难梭菌感染的治疗，开展难治性腹泻、便秘、放射性肠炎、营养不良和肝性脑病等疾病的临床研究。